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升级到 MySQL 8.4，MySQL 启动报错：io_setup() failed with EAGAIN

2024-07-01 14:19 由 iVictor 发表于 #数据库

问题

最近碰到一个 case，一台主机上，部署了多个实例。之前使用的是 MySQL 8.0，启动时没有任何问题。但升级到 MySQL 8.4 后，部分实例在启动时出现了以下错误。

[Warning] [MY-012582] [InnoDB] io_setup() failed with EAGAIN. Will make 5 attempts before giving up.
[Warning] [MY-012583] [InnoDB] io_setup() attempt 1.
[Warning] [MY-012583] [InnoDB] io_setup() attempt 2.
[Warning] [MY-012583] [InnoDB] io_setup() attempt 3.
[Warning] [MY-012583] [InnoDB] io_setup() attempt 4.
[Warning] [MY-012583] [InnoDB] io_setup() attempt 5.
[ERROR] [MY-012584] [InnoDB] io_setup() failed with EAGAIN after 5 attempts.
[ERROR] [MY-012954] [InnoDB] Cannot initialize AIO sub-system
[ERROR] [MY-012930] [InnoDB] Plugin initialization aborted with error Generic error.
[ERROR] [MY-010334] [Server] Failed to initialize DD Storage Engine
[ERROR] [MY-010020] [Server] Data Dictionary initialization failed.
[ERROR] [MY-010119] [Server] Aborting
[System] [MY-010910] [Server] /usr/local/mysql/bin/mysqld: Shutdown complete (mysqld 8.4.0)  MySQL Community Server - GPL.
[System] [MY-015016] [Server] MySQL Server - end.

下面我们来分析下这个报错的具体原因及解决方法。

定位过程

首先搜索下这个报错是在哪个文件产生的。

# grep "io_setup() failed" -r /usr/src/mysql-8.4.0
/usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:          ib::warn(ER_IB_MSG_757) << "io_setup() failed with EAGAIN."
/usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:            << "io_setup() failed with EAGAIN after "

接着分析该文件中产生报错的具体函数。

// storage/innobase/os/os0file.cc
bool AIO::linux_create_io_ctx(ulint max_events, io_context_t *io_ctx) {
  ssize_t n_retries = 0;
  for (;;) {
    memset(io_ctx, 0x0, sizeof(*io_ctx));
    int ret = io_setup(max_events, io_ctx);

    if (ret == 0) {
      /* Success. Return now. */
      return (true);
    }
    switch (ret) {
      case -EAGAIN:
        if (n_retries == 0) {
          /* First time around. */
          ib::warn(ER_IB_MSG_757) << "io_setup() failed with EAGAIN."
                                     " Will make "
                                  << OS_AIO_IO_SETUP_RETRY_ATTEMPTS
                                  << " attempts before giving up.";
        }
        if (n_retries < OS_AIO_IO_SETUP_RETRY_ATTEMPTS) {
          ++n_retries;
          ib::warn(ER_IB_MSG_758) << "io_setup() attempt " << n_retries << ".";
          std::this_thread::sleep_for(OS_AIO_IO_SETUP_RETRY_SLEEP);
          continue;
        }

        /* Have tried enough. Better call it a day. */
        ib::error(ER_IB_MSG_759)
            << "io_setup() failed with EAGAIN after "
            << OS_AIO_IO_SETUP_RETRY_ATTEMPTS << " attempts.";
        break;
        ...
    }
    ib::info(ER_IB_MSG_762) << "You can disable Linux Native AIO by"
                               " setting innodb_use_native_aio = 0 in my.cnf";

    break;
  }
  return (false);
}

可以看到，错误信息主要是在执行io_setup，产生 EAGAIN 错误时打印的。

函数中的io_setup是一个 Linux 系统调用，用于初始化一个异步 I/O (AIO) 上下文（context）。异步 I/O（AIO）允许程序在发出 I/O 操作请求后继续执行其他工作，而不是等待操作完成。io_setup是 Linux 内核提供的异步 I/O 接口，通常用于高性能应用程序和数据库系统，以实现非阻塞 I/O 操作。max_events 指定了这个异步 I/O 上下文可以处理的最大并发 I/O 请求数。io_setup执行成功时会返回 0，失败时则返回 -1，并通过 errno 表示具体错误。

当返回的错误是 EAGAIN 时，则意味着指定的 max_events 超过了系统允许的最大异步 I/O (AIO) 事件数。

系统允许创建的最大异步 I/O 事件数是在/proc/sys/fs/aio-max-nr中定义的，默认值跟系统有关，通常是 65536。

所以，解决方法找到了，直接调整/proc/sys/fs/aio-max-nr的值即可。

# echo 1048576 > /proc/sys/fs/aio-max-nr

注意这种只是临时修改，系统重启就会失效。如果要永久修改，需调整 /etc/sysctl.conf。

# vim /etc/sysctl.conf
fs.aio-max-nr=1048576
# sysctl -p

问题解决了，接下来我们分析下同一台主机，为什么之前的 MySQL 8.0 没问题，升级到 MySQL 8.4 就报错了呢？

这个时候，就需要分析函数中 max_events 的生成逻辑了。

堆栈信息

下面是AIO::linux_create_io_ctx函数被调用的堆栈信息。

#0  AIO::linux_create_io_ctx (max_events=256, io_ctx=0x7fffe02d1500)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:2559
#1  0x0000000004db1649 in AIO::init_linux_native_aio (this=0x7fffe02d1d70)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:6139
#2  0x0000000004db16ed in AIO::init (this=0x7fffe02d1d70)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:6167
#3  0x0000000004db1826 in AIO::create (id=LATCH_ID_OS_AIO_IBUF_MUTEX, n=256, n_segments=1)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:6200
#4  0x0000000004db1a2b in AIO::start (n_per_seg=256, n_readers=64, n_writers=4)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:6254
#5  0x0000000004db261a in os_aio_init (n_readers=64, n_writers=4)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/os/os0file.cc:6514
#6  0x0000000004ee6b4d in srv_start (create_new_db=false)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/srv/srv0start.cc:1743
#7  0x0000000004bdfc92 in innobase_init_files (dict_init_mode=DICT_INIT_CHECK_FILES, tablespaces=0x7fffe77bf720)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/handler/ha_innodb.cc:5744
#8  0x0000000004bf0e22 in innobase_ddse_dict_init (dict_init_mode=DICT_INIT_CHECK_FILES, tables=0x7fffe77bf740, 
    tablespaces=0x7fffe77bf720) at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/innobase/handler/ha_innodb.cc:13133
#9  0x00000000049153b8 in dd::bootstrap::DDSE_dict_init (thd=0xb7ce6b0, dict_init_mode=DICT_INIT_CHECK_FILES, 
    version=80300) at /usr/src/mysql-8.4.0/sql/dd/impl/bootstrap/bootstrapper.cc:746
#10 0x0000000004916195 in dd::bootstrap::restart_dictionary (thd=0xb7ce6b0)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/sql/dd/impl/bootstrap/bootstrapper.cc:907
#11 0x0000000003814e54 in bootstrap::handle_bootstrap (arg=0x7fffffffcf20)
    at /usr/src/mysql-8.4.0/sql/bootstrap.cc:340
#12 0x0000000005792a92 in pfs_spawn_thread (arg=0xb7ece50) at /usr/src/mysql-8.4.0/storage/perfschema/pfs.cc:3051
#13 0x00007ffff7bc6ea5 in start_thread () from /lib64/libpthread.so.0
#14 0x00007ffff5ff0b0d in clone () from /lib64/libc.so.6

堆栈中的重点是 #6 的srv_start函数，这个函数会调用os_aio_init来初始化异步 I/O 系统。

// storage/innobase/srv/srv0start.cc
dberr_t srv_start(bool create_new_db) {
  ...
  if (!os_aio_init(srv_n_read_io_threads, srv_n_write_io_threads)) {
    ib::error(ER_IB_MSG_1129);

    return (srv_init_abort(DB_ERROR));
  }
...

调用 os_aio_init 时，会传递两个参数：srv_n_read_io_threads 和 srv_n_write_io_threads。这两个参数实际上对应的就是 MySQL 中的 innodb_read_io_threads 和 innodb_write_io_threads，这两个参数分别用来表示 InnoDB 中用于读操作、写操作的 I/O 线程数。

如果初始化失败，会打印ER_IB_MSG_1129错误。

ER_IB_MSG_1129是一个预定义的错误代码，对应的错误信息是在share/messages_to_error_log.txt中定义的。

ER_IB_MSG_1129
  eng "Cannot initialize AIO sub-system"

所以，错误日志中看到的[ERROR] [MY-012954] [InnoDB] Cannot initialize AIO sub-system其实就是在这里打印的。

有的童鞋可能猜到了，异步 I/O 系统初始化失败与 innodb_read_io_threads 和 innodb_write_io_threads 的设置有关，事实也确实如此。

下面，我们分析下 MySQL 启动过程中需要初始化多少个异步 I/O 请求。

MySQL 启动过程中需要初始化多少个异步 I/O 请求？

异步 I/O 的初始化主要是在AIO::linux_create_io_ctx中进行的，接下来，我们分析下AIO::linux_create_io_ctx的调用场景：

场景1：AIO::is_linux_native_aio_supported

该函数用来判断系统是否支持 AIO。

bool AIO::is_linux_native_aio_supported() {
  ...
  if (!linux_create_io_ctx(1, &io_ctx)) {
    return (false);
  }
  ...
}

这里只会初始化 1 个异步 I/O 请求。

场景2：AIO::init_linux_native_aio

该函数是用来初始化 Linux 原生异步 I/O 的。

dberr_t AIO::init_linux_native_aio() {
  ...
  ulint max_events = slots_per_segment();
  for (ulint i = 0; i < m_n_segments; ++i, ++ctx) {
    if (!linux_create_io_ctx(max_events, ctx)) {
      return (DB_IO_ERROR);
    }
  }
  return (DB_SUCCESS);
}

函数中的 m_n_segments 是需要创建的异步 I/O (AIO) 上下文的数量，max_events 是每个异步 I/O (AIO) 上下文支持的最大并发 I/O 请求数。所以，这个函数会初始化 m_n_segments * max_events 个异步 I/O 请求。

在 MySQL 的启动过程中，AIO::is_linux_native_aio_supported 只被调用一次，而 AIO::init_linux_native_aio 则会被调用三次，分别用于 insert buffer 线程、读线程和写线程的初始化。

这两个函数都是在AIO::start中调用的。

// storage/innobase/os/os0file.cc
bool AIO::start(ulint n_per_seg, ulint n_readers, ulint n_writers) {
#if defined(LINUX_NATIVE_AIO)
  /* Check if native aio is supported on this system and tmpfs */
  if (srv_use_native_aio && !is_linux_native_aio_supported()) {
    ib::warn(ER_IB_MSG_829) << "Linux Native AIO disabled.";
    srv_use_native_aio = false;
  }
#endif /* LINUX_NATIVE_AIO */
  ...
  if (0 < n_extra) {
    ...
    s_ibuf = create(LATCH_ID_OS_AIO_IBUF_MUTEX, n_per_seg, 1);
   ...
  }
  ...
  s_reads =
      create(LATCH_ID_OS_AIO_READ_MUTEX, n_readers * n_per_seg, n_readers);
  ...
  s_writes =
      create(LATCH_ID_OS_AIO_WRITE_MUTEX, n_writers * n_per_seg, n_writers);

  ...
  return true;
}

函数中的 n_per_seg 实际上就是 max_events。

n_per_seg 等于 8 * OS_AIO_N_PENDING_IOS_PER_THREAD，因为 OS_AIO_N_PENDING_IOS_PER_THREAD 是个常量，值为 32，所以 n_per_seg 等于 256。

而AIO::init_linux_native_aio 中的 m_n_segments 实际上表示的是线程的数量：对于 insert buffer 线程，线程数为 1；对于读操作线程，线程数为 n_readers；对于写操作线程，线程数为 n_writers。

怎么知道 m_n_segments 就是线程的数量？

关键是在创建 AIO 对象时，会调用 AIO 的构造函数，而构造函数中的 m_slots 又决定了 max_events 的值。

AIO *AIO::create(latch_id_t id, ulint n, ulint n_segments) {
  ...
  AIO *array =
      ut::new_withkey<AIO>(UT_NEW_THIS_FILE_PSI_KEY, id, n, n_segments);
  ...
}

AIO::AIO(latch_id_t id, ulint n, ulint segments)
    : m_slots(n),
      m_n_segments(segments),
...
  
[[nodiscard]] ulint slots_per_segment() const {
  return (m_slots.size() / m_n_segments);
}

以读线程为例，AIO::create中的 n 等于 n_readers * n_per_seg，n_segments 等于 n_readers。

在初始化 AIO 对象时，n_readers * n_per_seg 将赋值给 m_slots，n_readers 将赋值给 m_n_segments。

所以AIO::init_linux_native_aio中的 max_events = slots_per_segment() = m_slots.size() / m_n_segments = n_readers * n_per_seg / n_readers = n_per_seg。

计算公式

基于上面的分析，我们可以推论出 MySQL 在启动过程中需要初始化的异步 I/O 请求数的计算公式。

(1 + innodb_read_io_threads + innodb_write_io_threads) * 256 + 1

最后一个 1 是判断系统是否支持 AIO。

验证

下面通过一个具体的案例来验证下上面的计算公式是否正确。

首先通过/proc/sys/fs/aio-nr查看当前系统中已分配的异步 I/O 请求的数量。

# cat /proc/sys/fs/aio-nr
4866

接着，启动一个 MySQL 8.4 实例，启动命令中显式设置 innodb_read_io_threads 和 innodb_write_io_threads。

# /usr/local/mysql8.4/bin/mysqld --defaults-file=/etc/my_3308.cnf --innodb-read-io-threads=64 --innodb-write-io-threads=4 &

实例启动后，再次查看/proc/sys/fs/aio-nr。

# cat /proc/sys/fs/aio-nr
22531

两个数之间的差值是 17665。

按照之前的公式计算，也是 17665，完全吻合。

(1 + 64 + 4) * 256 + 1 = 17665

为什么 MySQL 8.4 启动会报错呢？

因为 innodb_read_io_threads 的默认值在 MySQL 8.4 中发生了变化。

在 MySQL 8.4 之前，innodb_read_io_threads 默认为 4，而在 MySQL 8.4 中，innodb_read_io_threads 默认等于主机逻辑 CPU 的一半，最小是 4，最大是 64。

static MYSQL_SYSVAR_ULONG(
    read_io_threads, srv_n_read_io_threads,
    PLUGIN_VAR_RQCMDARG | PLUGIN_VAR_READONLY,
    "Number of background read I/O threads in InnoDB.", nullptr, nullptr,
    std::clamp(std::thread::hardware_concurrency() / 2, 4U, 64U), 1, 64, 0);

不巧，问题 case 主机的逻辑 CPU 是 128 核，所以就导致了 innodb_read_io_threads 等于 64。

这就意味着，在/proc/sys/fs/aio-max-nr等于 65536（默认值）的情况下，该主机上只能启动 3（65536/17665） 个 MySQL 8.4 实例。

结论

  1. MySQL 在启动时，如果出现io_setup() failed with EAGAIN错误，可适当增加/proc/sys/fs/aio-max-nr的值。
  2. MySQL 在启动过程中需要初始化的异步 I/O 请求数等于(1 + innodb_read_io_threads + innodb_write_io_threads) * 256 + 1
  3. innodb_read_io_threads 的默认值在 MySQL 8.4 中发生了变化，建议在配置文件中显式指定。

参考资料

io_setup(2) — Linux manual page: https://www.man7.org/linux/man-pages/man2/io_setup.2.html

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